Fakultas Ushuluddin dan Dakwah (USWAH), Intitut Agama Islam Negeri (IAIN) Ambon, berdiri pada tahun 1991 dan mengalami metamorfosis seiring perkembangnya dinamika Pendidikan Tinggi yang kemudian di sahkan berdasarkan Peraturan Menteri Agama RI No. 8 Tahun 2011 Tentang Perubahan atau Peraturan Menteri Agama No. 10 Tahun 2007 Tentang Pendirian Fakultas Ushuluddin dan Dakwah IAIN Ambon.
Fakultas USWAH terdiri dari 6 Jurusan yakni Akidah Filsafat Islam (AFI), Komunikasi Penyiaran Islam (KPI), Sosiologi Agama (SOSAG), Bimbingan Konseling Islam (BKI), Pengembangan Masyarakat Islam (PMI) dan Jurnalistik Islam.